Эндоскопическая  служба организована в ХОДКБ в 1988 г. Отделение оказывает плановую эндоскопическую помощь с 8⁰⁰ до 15⁰⁰ часов с понедельника по пятницу и круглосуточно работает в режиме неотложной эндоскопической помощи детям.
Отделение расположено на 1 этаже главного корпуса. В составе отделения имеется 3 профильных кабинета – бронхоскопический, колоноскопический и гастроскопический.

Владос Анатолий Александрович - заведующий отделением врач-эндоскопист высшей категории
Корниенко Александр Иванович – врач-эндоскопист 1 категории
Брюхно Алексанлр Григорьевич – врач-эндоскопист специалист

В числе диагностических эндоскопических манипуляций, проводимых в отделении:

• Эзофагогастродуоденоскопия;
• Ректороманоскопия;
• Колоноскопия;
• Различные методы эндоскопической диагностики инфекции Helicobacter pylori;
• Бронхоскопия.
  

В числе лечебных эндоскопических манипуляций, проводимых в отделении:

• Взятие биопсийного материала, смывов и секретов для различных видов исследований;
  
• Остановка кровотечений из органов желудочно-кишечного тракта;
  
• Удаление инородных тел органов желудочно-кишечного тракта и дыхательных путей;
  
• Удаление образований органов желудочно-кишечного тракта;
  
• Эндоскопическое проведение зондов в органы желудочно-кишечного тракта;
  
• Эндоскопическое введение лекарственных препаратов для лечения различных заболеваний.

Спектр патологии детей, проходящих обследование и лечение в отделении составляют:

• острые и хронические воспалительные заболевания, врождённые аномалии и пороки развития;
• химические и термические ожоги,
• рубцовые сужения, кровотечения,
• инородные тела,
• доброкачественные и злокачественные образования, травмы органов ЖКТ и дыхательных путей; варикозное расширение вен пищевода и желудка; инвагинации кишечника.